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韓國學(xué)者再質(zhì)疑韓春雨:該技術(shù)只能“沉默”基因
韓春雨的NgAgo技術(shù)深陷可重復(fù)性泥潭,韓國學(xué)者發(fā)表文章稱,NgAgo能在體外切割RNA(核糖核酸),而非如韓春雨論文所稱在哺乳細(xì)胞內(nèi)切割DNA(脫氧核糖核酸)。
2016年11月,在《自然-生物技術(shù)》上,韓國基礎(chǔ)科學(xué)研究所基因編輯中心金鎮(zhèn)洙(Jin-Soo Kim)團(tuán)隊與另兩個團(tuán)隊一起,發(fā)表了一篇評論通信文章,表示利用河北科技大學(xué)韓春雨課題組的NgAgo技術(shù)未能檢測到DNA引導(dǎo)的基因組編輯,質(zhì)疑了韓春雨NgAgo實驗的可重復(fù)性。
近2個月后,1月20日,在生命科學(xué)預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv上,金鎮(zhèn)洙發(fā)表了另一篇關(guān)于NgAgo技術(shù)的論文。BioRxiv由非營利機(jī)構(gòu)美國冷泉港實驗室創(chuàng)辦,旨在加速研究傳播,在科學(xué)家的論文正式開始同行評議前,使其獲得論文反饋的機(jī)會。
在論文中,金鎮(zhèn)洙沒有否定兩個月前那篇評論通信文章的結(jié)論,再次在文章中提到了無法重復(fù)實驗。但他發(fā)現(xiàn)了關(guān)于NgAgo另一個特性——在體外,NgAgo能作為一種DNA引導(dǎo)的核酸內(nèi)切酶切割RNA。
這意味著NgAgo或許可以作為“RNA干擾”的一種工具發(fā)揮作用。RNA干擾的一種形式是基因沉默,也就是讓特定基因不表達(dá),這可以用在疾病治療上,通過讓致病基因“沉默”來達(dá)到治療效果。
據(jù)《自然》雜志1月20日的報道,金鎮(zhèn)洙透露最近已經(jīng)申請了一項關(guān)于使用NgAgo進(jìn)行基因沉默的專利。
值得注意的是,韓春雨課題組于2016年5月在《自然-生物技術(shù)》發(fā)表關(guān)于NgAgo技術(shù)的論文,報告的是在哺乳細(xì)胞系統(tǒng)中,以DNA為介導(dǎo),NgAgo能對DNA進(jìn)行高效地切割編輯。這和金鎮(zhèn)洙最新報告的NgAgo特性并不一致——一個切割RNA,一個切割DNA,對應(yīng)不同概念。
此前,2016年11月,南通大學(xué)和復(fù)旦大學(xué)團(tuán)隊發(fā)表在《細(xì)胞研究(Cell Research)》上的一項研究和金鎮(zhèn)洙的最新結(jié)論相呼應(yīng)。
那篇發(fā)表在《細(xì)胞研究》上的論文顯示,研究團(tuán)隊在斑馬魚的細(xì)胞中使用NgAgo技術(shù)后,斑馬魚的眼睛發(fā)育出現(xiàn)了缺陷,疑似發(fā)生了基因編輯。但是進(jìn)行測序后才發(fā)現(xiàn),基因組層面上或者說DNA層面上,沒發(fā)生任何編輯。進(jìn)一步,他們檢測發(fā)現(xiàn),只是mRNA表達(dá)量上發(fā)生了改變。這意味著引起發(fā)育缺陷的原因是基因敲低,而不是基因編輯。
澎湃新聞此前也介紹過基因敲低和基因編輯的差別。簡單而言,基因敲低是對RNA進(jìn)行干擾,影響部分基因表達(dá),基因編輯則是對DNA進(jìn)行干擾,完全影響基因表達(dá)。兩者在效果上的差別可以形象理解為錘子和剪刀之別。
從生命體的運(yùn)轉(zhuǎn)流程說起。DNA是負(fù)責(zé)引導(dǎo)生物發(fā)育與生命機(jī)能運(yùn)作的“司令”,但具體的生物功能都由蛋白質(zhì)來執(zhí)行。所以,DNA需要先轉(zhuǎn)錄成為RNA,再通過RNA翻譯成蛋白質(zhì)。這個過程稱為基因表達(dá),其中,RNA充當(dāng)了中介的角色。
DNA與RNA之間的關(guān)系。 微信公眾號“賽先生” 圖
如果通過人為的方式,對RNA這個中介進(jìn)行干擾,使得基因表達(dá)降低,只能完成一小部分的基因表達(dá),讓蛋白質(zhì)無法正常工作,我們就將這一現(xiàn)象稱為“基因敲低”。如果是對DNA這個發(fā)號“司令”進(jìn)行變動,使得基因的序列發(fā)生變化,那是更高級別的干預(yù),會完全改變基因表達(dá),我們稱為“基因編輯”。
此外,澎湃新聞了解到,NgAgo蛋白酶是Ago家族成員之一,而Ago能降解、調(diào)解RNA的研究結(jié)論并不新鮮,只是有的Ago通過RNA引導(dǎo),有的通過DNA引導(dǎo)。金鎮(zhèn)洙的最新研究是進(jìn)一步揭示了NgAgo如何干預(yù)RNA的機(jī)制。
值得一提的是,越來越多的跡象都在指向NgAgo技術(shù)或許只是在基因沉默上有潛力,而非基因編輯。
在《自然》雜志1月20日的報道中,韓春雨表示,諾維信有證據(jù)表明NgAgo能進(jìn)行基因調(diào)控,并透露諾維信認(rèn)可這一點(diǎn)。但《自然》雜志同時指出,基因調(diào)控既可以通過基因編輯也可以通過基因沉默來實現(xiàn)。韓春雨對《自然》表示,透露更多涉及專利的信息之前,他需要和律師商談。
1月19日的兩則動態(tài)讓韓春雨NgAgo技術(shù)的可重復(fù)性爭議有了新進(jìn)展。
這一天中午,《自然-生物技術(shù)》表示獲得了與NgAgo系統(tǒng)可重復(fù)性相關(guān)的新數(shù)據(jù),需要進(jìn)行調(diào)查研究。韓春雨向澎湃新聞表示這是他們團(tuán)隊提交的,并否認(rèn)了是原始數(shù)據(jù)。
緊接著,當(dāng)日下午,河北科技大學(xué)官網(wǎng)貼出了“河北科技大學(xué)基因編輯技術(shù)研究中心與諾維信公司簽署合作協(xié)議”的文章。次日,諾維信公司發(fā)表聲明承認(rèn)在NgAgo上達(dá)成合作。但河北科技大學(xué)和諾維信公司都在重復(fù)性問題上避而不提,只是分別表示NgAgo在“真菌表達(dá)系統(tǒng)”和“生產(chǎn)酶的微生物表達(dá)系統(tǒng)”上有潛力。
澳大利亞大學(xué)約翰?克汀醫(yī)學(xué)研究中心的基因?qū)W家加埃唐?布爾焦(Gaetan Burgio)是最早公開質(zhì)疑NgAgo實驗可重復(fù)性的生物學(xué)家之一,他在小鼠受精卵中進(jìn)行了實驗,但未看到有基因編輯跡象。
布爾焦在接受《自然》采訪時提到,諾維信有一項用于基因沉默的RNA干擾技術(shù),布爾焦推測諾維信與河北科技大學(xué)基因編輯技術(shù)研究中心可能是找到了一種更有效的方法來沉默基因。
對于諾維信和河北科技大學(xué)基因編輯技術(shù)研究中心的合作,北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授魏文勝對《自然》表示:“這不能改變什么。韓春雨(在論文中)說NgAgo能在哺乳細(xì)胞系統(tǒng)中高效地進(jìn)行基因編輯。那就證明這個!”
編輯:薛曉鈺
關(guān)鍵詞:韓國 韓春雨 技術(shù)