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我國(guó)科學(xué)家成功破譯南美白對(duì)蝦基因組

2019年01月24日 16:21 | 作者:張旭東 | 來(lái)源:新華社
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新華社青島1月24日電(記者張旭東)中國(guó)科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)歷時(shí)10年成功破譯凡納濱對(duì)蝦(又稱“南美白對(duì)蝦”)基因組,并獲得高質(zhì)量的對(duì)蝦基因組參考圖譜,研究成果在《自然》雜志子刊《自然通訊》在線發(fā)表。

中國(guó)科學(xué)院海洋研究所研究員相建海介紹,對(duì)蝦基因組是世界上公認(rèn)的高復(fù)雜基因組,中國(guó)科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)嘗試了從一代到三代的各種基因組測(cè)序平臺(tái)及各種組裝軟件,最終完成了凡納濱對(duì)蝦的全基因組測(cè)序和組裝,并獲得了高質(zhì)量的對(duì)蝦基因組參考圖譜。

通過(guò)分析發(fā)現(xiàn),凡納濱對(duì)蝦共有約24億個(gè)堿基對(duì)。以1-6堿基為單位多次重復(fù)的簡(jiǎn)單串聯(lián)序列(SSR)占對(duì)蝦基因組的23.93%以上,是目前已測(cè)基因組物種中含量最高的,這也是對(duì)蝦基因組高復(fù)雜性的根本原因。

此外,科研人員在對(duì)蝦基因組上發(fā)現(xiàn)了兩大結(jié)構(gòu)特征:大量的物種特異性基因和大量的串聯(lián)重復(fù)基因,這可能與對(duì)蝦科的特異性進(jìn)化有密切聯(lián)系。

中國(guó)科學(xué)院海洋研究所研究員李富花表示,對(duì)蝦基因組的破譯,為甲殼動(dòng)物底棲適應(yīng)和蛻皮等研究提供了重要理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐,同時(shí)也為對(duì)蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要基礎(chǔ)平臺(tái)。

據(jù)了解,凡納濱對(duì)蝦作為四大養(yǎng)殖蝦類之首,其全球年產(chǎn)量達(dá)416萬(wàn)噸,具有非常重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。我國(guó)的凡納濱對(duì)蝦產(chǎn)量占全球的四分之一以上。由于種質(zhì)資源匱乏,我國(guó)每年需從國(guó)外引進(jìn)大量凡納濱對(duì)蝦苗種。

“凡納濱對(duì)蝦基因組的破譯,將有力促進(jìn)我國(guó)對(duì)蝦分子育種和全基因組育種的發(fā)展,產(chǎn)生我國(guó)自主培育的凡納濱對(duì)蝦品種,推動(dòng)我國(guó)種業(yè)發(fā)展?!崩罡换ㄕf(shuō)。

編輯:李敏杰

關(guān)鍵詞:基因組 破譯 納濱

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