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滅絕物種RNA首次分離測序,為復(fù)活物種或研究RNA病毒開創(chuàng)新方向
瑞典國家分子生物科學(xué)中心科學(xué)家首次分離和測序了一個已滅絕物種的RNA分子,從而重建了該滅絕物種(塔斯馬尼亞虎)的皮膚和骨骼肌轉(zhuǎn)錄組。該項成果對復(fù)活塔斯馬尼亞虎和毛猛犸象等滅絕物種,以及研究如新冠病毒等RNA病毒具有重要意義。相關(guān)論文刊發(fā)于最新一期《基因組研究》雜志。
研究中使用的塔斯馬尼亞虎標(biāo)本,在室溫下干燥保存于瑞典國家歷史博物館。圖片來源:《基因組研究》
塔斯馬尼亞虎,也稱為袋狼,是一種頂級食肉有袋動物,曾經(jīng)漫步在澳大利亞大陸和塔斯馬尼亞島,最后一只塔斯馬尼亞虎于1936年在塔斯馬尼亞州博馬里斯動物園死亡,自此該物種宣告滅絕。
研究人員指出,重建一只功能性的活塔斯馬尼亞虎不僅需要對其基因組(DNA)有全面了解,還需要對組織特異性基因表達(dá)動力學(xué)和基因調(diào)控如何發(fā)揮作用有全面的認(rèn)識,而這些只有通過研究其轉(zhuǎn)錄組(RNA)才能實現(xiàn)。
在最新研究中,研究人員首次對瑞典自然歷史博物館保存的一只130年前的干燥塔斯馬尼亞虎標(biāo)本的皮膚和骨骼肌組織轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測序,從而鑒定出了這個物種的組織特異性基因表達(dá)特征。獲取的轉(zhuǎn)錄組質(zhì)量非常好,研究人員識別出其肌肉和皮膚特異性蛋白質(zhì)編碼RNA,并對缺失的核糖體RNA和微小RNA基因進(jìn)行了注釋。
這項開創(chuàng)性研究第一次檢測到了一個多世紀(jì)前滅絕的袋狼特異性調(diào)控基因(如微小RNA),為探索儲存在全球博物館的大量標(biāo)本和組織開辟了新機會,那里有很多RNA分子等待被發(fā)現(xiàn)和測序。未來人們不僅可從滅絕動物身上獲取RNA,還可從博物館收藏的蝙蝠和其他宿主生物的皮膚上獲取新冠病毒等RNA病毒基因組及其進(jìn)化前體。
編輯:馬嘉悅