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中國病毒追蹤者:蝙蝠已成新興病毒天然“蓄水池”
SADS冠狀病毒導致疫情
基于SADS是一種未知病毒引起的新疫情這點假設(shè),研究團隊開始正式解謎。
研究團隊從患病仔豬小腸中收集樣本,用高通量測序技術(shù)來進行宏基因組學分析。最終發(fā)現(xiàn),SADS冠狀病毒和蝙蝠冠狀病毒HKU2序列匹配。通過重新組裝,研究團隊獲得了27173bp的SADS冠狀病毒基因,和HKU2冠狀病毒有95%的序列一致性。HKU2首先發(fā)現(xiàn)于在香港和廣東的中華菊頭蝠中。
研究團隊發(fā)現(xiàn),在4個養(yǎng)豬場的急性病仔豬和母豬身上均檢測到了SADS冠狀病毒,在恢復或健康的豬身上則沒有,在附近沒有SADS跡象的養(yǎng)豬場里也沒有檢測到。
回顧性PCR分析顯示,在PEDV爆發(fā)的時候,A農(nóng)場里還同時存在SADS冠狀病毒,該農(nóng)場里于2016年12月提取的第一個樣本表現(xiàn)出SADS冠狀病毒強陽性。但從2017年1月中旬開始,SADS冠狀病毒成為了病豬里檢測到的主要病毒。
研究團隊認為,在PEDV感染完全檢測不到后出現(xiàn)了仔豬的大規(guī)模死亡這一事實,暗示是SADS冠狀病毒引起了豬的致命感染,是那些大規(guī)模疫情爆發(fā)的真正原因,PEDV則不是直接因素。
在SADS爆發(fā)高峰期、以及爆發(fā)后期,4個養(yǎng)豬場里都沒有檢測到PEDV和其他一直的豬腹瀉病毒的存在,這些都支持了上述結(jié)論。
來源于菊頭蝠
值得注意的是,盡管如前所述,SADS冠狀病毒和 HKU2冠狀病毒全基因組的一致性達到95%,但刺突蛋白基因序列的一致性僅86%。
刺突蛋白是什么?周鵬對澎湃新聞解釋,“冠狀病毒都是用刺突蛋白來入侵細胞,就像‘鑰匙’和‘鎖’一樣,它依賴于刺突蛋白和細胞表面的受體結(jié)合,然后才能進入細胞,成功感染,但如果這個刺突蛋白變異很大的話,它就不能利用受體了?!?/p>
周鵬強調(diào),“基于這樣的原因, 86%一致性這樣的數(shù)據(jù),我們認為SADS冠狀病毒和 HKU2冠狀病毒關(guān)系還不是最直接的。我們之前有做SARS經(jīng)驗,最終發(fā)現(xiàn)跟SARS的刺突蛋白一致性達到97%、98%這個樣子,才能夠直接利用人的受體,感染成功?!?/p>
基于這個理論,研究團隊繼續(xù)找其他來源于蝙蝠的冠狀病毒。
研究團隊隨后篩選了團隊在2013年至2016年從廣東省的7個不同地點采集的591個蝙蝠肛門拭子。肛門拭子即用棉簽在蝙蝠的肛門處掏一下,而取樣時間則一般在每年的春季和秋季。
團隊篩選后發(fā)現(xiàn),58(9.8%)個蝙蝠肛門拭子樣本顯示出陽性,且都來源于中華菊頭蝠。菊頭蝠因有結(jié)構(gòu)復雜的馬蹄形鼻葉而得名,也是SARS等許多動物源病毒的重要宿主。
高通量測序則得出,這種來源于中華菊頭蝠中的冠狀病毒(暫時稱“SADSr冠狀病毒”)和SADS冠狀病毒在大小(27.2kb)上近似,總體序列一致性在96%-98%之間。
更重要的是,兩者刺突蛋白(樣本分別為162149和141388)的序列一致性超過了98%。
周鵬提到,“我們目前的結(jié)論是,后來在蝙蝠中發(fā)現(xiàn)SADSr冠狀病毒可能是病豬中發(fā)現(xiàn)的這個新病毒SADS冠狀病毒的祖先,但同樣直接來源于蝙蝠中的HKU2冠狀病毒和SADSr冠狀病毒可能來源于一個祖先?!?/p>
石正麗還提到,團隊在豬場周圍確實發(fā)現(xiàn),有蝙蝠在豬場周圍飛翔?!斑@些豬場感覺是比較新建的,它的位置是在城外,旁邊就是一個小山丘,我們認為這個小山丘附近是有蝙蝠棲息地的。所以很明顯這個傳播途徑就是通過糞便污染豬場的環(huán)境,最后污染到豬?!?/p>
不過,周鵬同時提到,“盡管我們認為SADS冠狀病毒是一種完全新型的病毒,但現(xiàn)在有一個困難是我們還沒有鑒定出這種新型蛋白它的受體是什么,所以還不好這樣說?!?/p>
編輯:周佳佳
關(guān)鍵詞:中國病毒追蹤者 蝙蝠