1993年起劉貫文就不再參加三晉文化研究會(huì)的活動(dòng)，但直到1999年，徐繼畬文物仍然被其擁有。1999年11月11日，三晉文化研究會(huì)副秘書(shū)長(zhǎng)劉在文在接受法官?gòu)埣冋{(diào)查時(shí)提到，徐繼畬文物是“劉貫文主管，名義上是捐給三晉文化研究會(huì)的”。

　　1999年11月11日下午，在劉貫文在家中向辦案法官?gòu)埣兂姓J(rèn)，徐繼畬文物很多的確在他手里，不過(guò)是做研究之用，“我手中保管的東西，是為三晉文化研究會(huì)保管。”

　　此外，接受法官調(diào)查時(shí)，徐繼畬文物的一部分由山西省社科院干部崔正森保管。崔正森此前是三晉文化研究會(huì)學(xué)術(shù)部的人，但此時(shí)學(xué)術(shù)部已經(jīng)不存在了。

　　官司

　　文物捐贈(zèng)后，戶口卻始終沒(méi)有解決。如今已50歲的徐進(jìn)偉依然是農(nóng)民。

　　當(dāng)時(shí)三晉文化研究會(huì)學(xué)術(shù)部的崔正森曾到徐進(jìn)偉所在的五臺(tái)縣，想讓當(dāng)?shù)貛兔k理戶口。五臺(tái)縣對(duì)徐繼畬文物流出當(dāng)?shù)胤浅２粷M。時(shí)任五臺(tái)縣委書(shū)記周新玉所寫的證明材料提到，五臺(tái)縣時(shí)任副縣長(zhǎng)張?jiān)茦菍?duì)崔正森說(shuō)，“你不經(jīng)過(guò)縣政府，就私自拉走徐家文物，是違法的。你再說(shuō)，我讓公安局和你談話。”

　　徐家于2000年將三晉文化研究會(huì)告上法庭，請(qǐng)求法院判決捐贈(zèng)行為無(wú)效，想索回家里捐贈(zèng)的文物。徐繼畬文物捐贈(zèng)案歷經(jīng)太原市迎澤區(qū)法院、太原市中級(jí)法院、山西省高級(jí)法院審判。太原市中級(jí)法院駁回訴訟請(qǐng)求，山西省高級(jí)法院維持原判。這樣，徐進(jìn)偉處于一種既沒(méi)有得到城市戶口，又失去徐繼畬文物的狀態(tài)。

　　但在案件偵辦過(guò)程中，關(guān)于本次捐贈(zèng)的另一個(gè)問(wèn)題浮現(xiàn)出來(lái)：部分文物已經(jīng)遺失。

　　在太原市中院審案中，對(duì)于這批后來(lái)找不到的文物，三晉文化研究會(huì)當(dāng)時(shí)答復(fù)稱，具體保管人外出未能見(jiàn)到。

　　2000年，國(guó)家文物局答復(fù)太原市中院的函件提到，三晉文化研究會(huì)應(yīng)集中保管徐繼畬有關(guān)文物資料，或交由具有保管能力的山西省博物館管理。

　　2001年1月19日，徐繼畬文物原來(lái)的保管者三晉文化研究會(huì)將文物移交給了山西省博物館。正是在移交過(guò)程中，一個(gè)嚴(yán)重的問(wèn)題暴露出來(lái)：其中28件文物下落不明，包括《乾隆四十二年誥封徐繼畬曾祖父母圣旨》。

　　徐繼畬文物此前保管的混亂狀態(tài)方被社會(huì)廣泛關(guān)注。

　　2001年2月21日，三晉文化研究會(huì)副秘書(shū)長(zhǎng)雷忠勤在山西省高院庭審時(shí)做了《徐繼畬文物資料存放的現(xiàn)狀》說(shuō)明。該說(shuō)明稱，“還有25件資料，由于某種特定的暫時(shí)性原因，至今仍在繼續(xù)整理中。我本人就參與了這一清理活動(dòng)。”但該說(shuō)明沒(méi)有指出清理活動(dòng)到底是什么，而是較模糊地提到，“把這一清理工作進(jìn)行到底，包括必要時(shí)采用其他一切合法的手段和形式進(jìn)行清理。”

　　2001年5月16日，山西省高院書(shū)面通知三晉文化研究會(huì)，要求限期將徐繼畬的28件文物資料全部移交給山西省博物館，否則將依法承擔(dān)法律后果。

　　2001年5月31日，三晉文化研究會(huì)給時(shí)任山西省政法委書(shū)記杜玉林的報(bào)告中稱，“其余文物資料，由于歷時(shí)已久，其間學(xué)術(shù)部也有過(guò)人員變動(dòng)，劉貫文早已退休，年事已高，且健康狀況不佳，記憶衰退，雖經(jīng)查找小組努力查找，至今未能如數(shù)找到原件。”

　　劉貫文于2007年去世。