15年前，對人類基因組進行測序需要花費大約30億美元，而今只需數(shù)千美元?？萍及l(fā)展日新月異，新的一年又會有哪些令人期待的突破？英國《自然》雜志近日采訪了生物醫(yī)學領域的專家，為人們梳理出有望改變2018年生命科學研究面貌的技術和課題，其中包括為轉(zhuǎn)錄組繪圖、促進癌癥疫苗研發(fā)、建立科學物聯(lián)網(wǎng)等。

為轉(zhuǎn)錄組繪圖

全球性的人類細胞圖譜(HCA)計劃旨在確定人體內(nèi)所有細胞類型并繪制其空間組織，而完成此項目需要很多輔助技術。

單細胞RNA測序是識別不同細胞類型的有效方法，也是創(chuàng)建HCA的重要工具，這一方法需要將組織分離成單個細胞，然后隔離出RNA，但這樣做無法保留細胞在組織中的空間環(huán)境，即它們是如何組織以及相互作用的。

哈佛大學先進成像中心主任莊小威說，因此需要一種技術，可以對完整組織中細胞的轉(zhuǎn)錄組(細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運RNA等)成像，從而提供這種空間背景。他的實驗室正在開發(fā)多重抗誤差熒光原位雜交技術(MERFISH)，這是一種基于圖像的單細胞轉(zhuǎn)錄組學方法，能對單細胞中1000個不同的信使RNA(mRNA)成像，然后通過細胞的基因表達圖譜對其分類，并繪制出其空間組織。隨著技術進一步發(fā)展，MERFISH有潛力檢測完整組織細胞中的全部轉(zhuǎn)錄組。

促進癌癥疫苗研發(fā)

在癌癥免疫基因組學領域，研究人員想知道，哪些由癌癥基因組編碼的突變蛋白——新抗原能在個體中引發(fā)免疫應答，并基于此開發(fā)個性化癌癥疫苗或其他療法。質(zhì)譜流式細胞技術(CyTOF)可用于研究這些新抗原。

全美兒童醫(yī)院聯(lián)合基因組醫(yī)學研究所所長伊蘭·馬蒂斯說，這項技術能確定癌細胞產(chǎn)生最多、且對免疫系統(tǒng)產(chǎn)生強烈反應的新抗原是哪種，然后用這些信息創(chuàng)建個性化的抗癌疫苗，這些疫苗與新型抗癌藥物結(jié)合使用，有望使患者最終擺脫疾病困擾。

CyTOF不僅對癌癥基因組學有用，還可用于追蹤由細胞產(chǎn)生的任何蛋白的豐度和組成，使我們能更多維、更精確地了解蛋白質(zhì)。

擴展基因組序列分析

2000年，一種全新的激素——促性腺激素抑制激素(GnIH)被發(fā)現(xiàn)。研究表明，當動物遭受壓力時，這種激素會抑制生殖軸。對GnIH的研究正在徹底改變我們對大腦調(diào)控生殖的理解。

今天，得益于高通量DNA測序技術，基因組測序的價格在不斷下降。加州大學戴維斯分校生殖生物學家瑞貝卡·卡利斯·洛迪古斯說，這使科學家能研究那些在實驗室通常不被研究的動物，獲得更多與生殖有關的數(shù)據(jù)，例如，他們最近使用RNA測序來更深入地了解普通鴿的生殖軸如何對壓力作出反應。慢性壓力會影響生殖，他們希望借此具體了解這一點。

同時，他們也在研究在生殖軸——大腦中的下丘腦、腦下垂體和生殖腺上轉(zhuǎn)錄活躍的每一個基因，得到的龐大的數(shù)據(jù)集產(chǎn)生了數(shù)百個假設，有助于進一步理解壓力對生殖機制的影響，從而為數(shù)百萬有生育問題的人提供基因干預或治療。

建立科學物聯(lián)網(wǎng)

物聯(lián)網(wǎng)是智能傳感器和執(zhí)行器的集群，這些分布式的智能設備正在改變我們的生活，也有望改變科研的面貌。

研究人員已開始在分布式科學物聯(lián)網(wǎng)(IoST)上開展合作。IoST是一個開放系統(tǒng)，將分布式傳感器和執(zhí)行器連接到強大的機器學習平臺，從而促進全球性實驗。

即使是該系統(tǒng)的簡化版，也有巨大作用。谷歌發(fā)現(xiàn)，其智能手機可從手機加速計和陀螺儀檢測到的步態(tài)變化中發(fā)現(xiàn)帕金森病早期癥狀。加州大學伯克利分校理論神經(jīng)科學家薇薇安·明也說，使用智能手機傳感器，她的團隊能預測雙相情感障礙患者的躁狂發(fā)作。但現(xiàn)在，很多科學家無法獲得這種實驗能力。

試想一下，如果研究人員能訪問運行IoST應用的智能手機、智能手表和世界各地實驗室的數(shù)據(jù)；AI系統(tǒng)可挖掘你所在領域已發(fā)布研究和數(shù)據(jù)，等等，將會給科學研究帶來多大突破？

當然，這些大規(guī)模分布式系統(tǒng)存在一些可怕的因素，如某些組織是否會對數(shù)據(jù)進行限制性控制？新平臺的研究成果通過傳統(tǒng)科學出版商，還是arXiv這樣的開放獲取平臺提供？

雖然獲取渠道和倫理問題必須解決，但轉(zhuǎn)型更加迫切。有些實驗室和研究人員已在充分利用這些可能性。建立這些系統(tǒng)，有望使出版更平等、數(shù)據(jù)可共享、科學更透明。

(科技日報北京1月30日電)