1986年10月25日，撫順縣第一工業(yè)局、撫順縣化肥廠與東北制藥總廠簽訂了《經(jīng)濟(jì)技術(shù)聯(lián)合協(xié)議書》，1986年11月27日又簽訂補(bǔ)充協(xié)議書；

1988年11月15日，東北制藥總廠與撫順縣第一工業(yè)局、撫順縣財(cái)政局簽署了《關(guān)于承包經(jīng)營撫順縣化肥廠協(xié)議書》，東北制藥總廠作為承包人，撫順縣第一工業(yè)局、撫順縣財(cái)政局作為發(fā)包人，協(xié)議約定東北制藥總廠承包經(jīng)營撫順縣化肥廠20年，承包期從1988年1月1日起至2007年12月31日止；

2003年2月，在《關(guān)于承包經(jīng)營撫順縣化肥廠協(xié)議書》未到期的情況下，撫順縣經(jīng)濟(jì)貿(mào)易局將撫順縣化肥廠的產(chǎn)權(quán)轉(zhuǎn)讓給億華實(shí)業(yè)，并簽訂了《撫順縣化肥廠產(chǎn)權(quán)出售協(xié)議》。

2004年2月，億華實(shí)業(yè)對東北制藥總廠提起訴訟，要求東北制藥總廠償還承包撫順化肥廠期間造成的經(jīng)營虧損。

上述東北制藥總廠為東北制藥1993年設(shè)立之初的三大資產(chǎn)之一。1993年，東北制藥集團(tuán)有限責(zé)任公司以其下屬的東北制藥總廠、沈陽第一制藥廠和東北制藥集團(tuán)公司供銷公司的生產(chǎn)經(jīng)營性資產(chǎn)，以及三家企業(yè)所占用土地的土地使用權(quán)，折價(jià)入股東北制藥。

億華實(shí)業(yè)于2004年提起訴訟后，2005年8月16日，遼寧省高院駁回其訴訟請求，億華實(shí)業(yè)不服一審判決向最高人民法院提起上訴；

2007年9月20日，最高人民法院撤銷一審判決發(fā)回遼寧省高級人民法院重新審理；

2008年2月22日，遼寧省高院以“因其他衍生訴訟的結(jié)果將影響案件審理”為由，裁定案件中止審理。

公告稱，今年3月，由于其他衍生訴訟案件均已結(jié)案，案件恢復(fù)審理。11月20日，東北制藥從遼寧省高院領(lǐng)取了恢復(fù)審理的訴訟材料，開庭時(shí)間尚未確定。

實(shí)控人從沈陽市國資委變更為“方大系”掌舵人方威

7月19日，東北制藥披露公告稱，公司控股股東變更為遼寧方大集團(tuán)實(shí)業(yè)有限公司（下稱“遼寧方大”），實(shí)際控制人變更為遼寧方大董事局主席方威。方威同時(shí)還是上市公司方大炭素、方大特鋼的實(shí)際控制人。

今年5月9日，東北制藥完成以8.96元/股發(fā)行9493萬股的非公開發(fā)行，共募集資金8.5億元，其中，遼寧方大斥資6.73億元認(rèn)購7510萬股，認(rèn)購?fù)瓿珊?，遼寧方大合計(jì)持股東北制藥13.20%。

隨后，遼寧方大又分別于5月28日-6月1日、6月8日-6月12日、6月25日-7月2日期間，通過二級市場多次增持東北制藥股份。截至2018年三季度報(bào)，遼寧方大合計(jì)持有東北制藥1.48億股，持股比例為26.02%，躍升為東北制藥第一大股東。

原控股股東東北制藥集團(tuán)有限責(zé)任公司和第二大股東中國華融資產(chǎn)管理股份有限公司，分別持股17.54%和6.03%，退居?xùn)|北制藥第二大和第三大股東。