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分離RNA結(jié)合蛋白有了新技術(shù)
北京時(shí)間2月13日零時(shí),中國科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院的米格爾·埃斯特班、張必良和鮑習(xí)琛所領(lǐng)銜科研團(tuán)隊(duì)在《自然·方法學(xué)》雜志在線發(fā)表了分離RNA結(jié)合蛋白的新技術(shù),該技術(shù)是全面分析細(xì)胞內(nèi)的RNA—蛋白相互作用的重要工具,有助于揭開基因組中的“暗物質(zhì)”——非編碼RNA的未知功能。
有數(shù)以百計(jì)的蛋白質(zhì)可以與RNA結(jié)合,其中很多涉及神經(jīng)退行性病變、自身免疫缺陷和癌癥等疾病。那么,如何系統(tǒng)地分離RNA結(jié)合蛋白的問題變得引人注目。前期科學(xué)家們系統(tǒng)地分離了細(xì)胞內(nèi)mRNA結(jié)合蛋白,這只是眾多轉(zhuǎn)錄本中的一部分,細(xì)胞還包含了很多非polyA RNA。
該科研團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了RICK技術(shù),利用核酸標(biāo)記技術(shù),巧妙地將新合成的RNA標(biāo)記上生物素,通過鏈霉親和素偶聯(lián)的磁珠,分離得到相應(yīng)被標(biāo)記的RNA分子和與其相結(jié)合的蛋白分子。
通過這一技術(shù),研究人員系統(tǒng)地分離了包括非polyA尾RNA和新生RNA在內(nèi)的一系列RNA分子及其結(jié)合蛋白。進(jìn)一步的分析發(fā)現(xiàn),細(xì)胞分裂調(diào)控因子作為新的RNA結(jié)合蛋白,存在結(jié)合非polyA尾RNA的潛能。研究人員縮短標(biāo)記的時(shí)間,成功地在細(xì)胞中分離了新生RNA結(jié)合蛋白。這些蛋白與新生RNA的轉(zhuǎn)錄及后續(xù)的加工、剪切等調(diào)控密切相關(guān)。這一技術(shù)的應(yīng)用將有助于深入地剖析RNA結(jié)合蛋白的作用機(jī)制,也是細(xì)胞命運(yùn)轉(zhuǎn)變過程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。(記者葉青 通訊員黃博純)
編輯:趙彥
關(guān)鍵詞:分離RNA 結(jié)合蛋白 新技術(shù)